隨著科學技術的發展和人們對生物安全意識的提高，生物安全柜在實驗室、醫院及研究單位的應用日益廣泛，但是在人們在觀念里認為是最簡單的排風設備，選型、安裝、使用等方面中存在很多問題和誤區，給生物安全防護、避免實驗室感染帶來極大的隱患。
誤區一：潔凈工作臺代替生物安全柜
目前有很多醫院在大量使用醫用潔凈工作臺，很多操作人員認為這兩種設備外形相同，作用大同小異，并認為他們操作的樣本都是普通的樣本，不具有高致病性。其實，生物安全柜和潔凈工作臺具有本質的差別，潔凈工作臺將通過高效過濾器的凈化空氣向下吹過工作區，用來保護樣品，由于工作區是正壓區，氣流通過操作窗口外溢，只保護樣品，而對操作人員和環境不提供保護，如操作含有任何已知或潛在致病氣溶膠，都會給操作人員帶來極大隱患。
生物安全柜是一種負壓凈化工作臺，可以防止操作者和環境暴露于實驗室過程中產生的有害氣溶膠，是傳染性微生物的牢籠，正確地操作生物安全柜，能夠完全保護操作人員、樣品、工作環境。因此，醫院臨床檢驗、診斷、病理分析、腫瘤藥物的配制等工作及相關生物醫學研究所、實驗室都應使用生物安全柜。
同時，為了安全起見，各醫療單位及相關實驗室應重新對實驗室微生物危險度進行評估，如有潛在危險，應及時替換原有潔凈工作臺，并根據需要選配生物安全柜。
誤區二：超前化
生物安全柜選型不當，根據結構設計、排風比例和保護對象和程度不同，生物安全柜分為Ⅰ級、Ⅱ級和Ⅲ級，其中Ⅱ級又分為A2、B2型。不同級別的生物安全實驗室應選用不同級別的生物安全柜，也可根據要保護、防護的不同類型來選擇適當的安全柜。在操作少量揮發性化學試劑或放射性核素時，可選擇Ⅱ級B2型生物安全柜；操作大量揮發性化學試劑或放射性核素時，必須使用Ⅱ級B2型生物安全柜。目前全世界應用最廣的是Ⅱ級A2型安全柜，它能夠滿足醫院的一般用途，另外，從節能角度也較為經濟。在實際工作中，很多單位認為設備選型應具有一定的超前性，常常在A2型能滿足應用的情況下選用B2型，造成問題很多。安全柜的選擇應主要從安全柜的性能考慮，如高效過濾器、風路設計、報警裝置、負壓保護等指標比較安全柜的優略。
誤區三：安全柜安裝問題多多
現有實驗室購置安全柜，一般在房間騰出一小塊空地安放，存在問題很多，安裝位置不當，會造成污染。生物安全柜兩側、后側應留30 cm，頂部留出足夠30～34 cm的空間；為減少氣流擾動，保證安全柜正常工作，生物安全柜應放置在遠離實驗室入口、門窗、暖氣、走道，避開送風口，避免外界氣流對柜內氣流造成擾動。生物安區柜放置的房間必須有足夠的送風量，Ⅱ級A2排氣量約在700～1200 m3/h，B2則在1000～1600 m3/h,有的型號更高，如果沒有足夠的補充送風，生物安全柜所在房間成為高負壓狀態，生物安全柜無法正常工作。很多實驗室購置Ⅱ級A2生物安全柜后，認為排風管道接到室外比排到室內安全。其實，生物安全柜排風出口帶有高效過濾器，所排出的氣體被證明是安全的，對室內環境沒有影響；另外，將室內舒適工作環境的潔凈空氣排到室外會大大增加運行成本，因此，除了操作危險度較高的實驗對象或能產生化學氣味的化學試劑，Ⅱ級A2生物安全柜排風排到室內是安全可行的。
Ⅱ級A2型生物安全柜采用硬連接，這種連接方式以前被廣泛使用，A2型生物安全柜使用密閉硬管連接到帶抽風機的排風系統時，其安全運行完全依賴于排風系統，如當排風的速度升高或降低，生物安全柜內不平衡發生變化，會產生污染環境、樣品的嚴重后果。在美國NSF49:2002標準中禁止Ⅱ級A2生物安全柜使用密閉硬管連接。如果Ⅱ級A2安全柜外排氣體時，建議排風管采用套管連接，套管安裝在生物安全柜的排風管上，與安全柜高效過濾器之間保留2.5 cm的縫隙，以便讓房間的空氣也能吸入到建筑物的排風系統中，這種連接方式是最安全的連接方式，柜內的氣流平衡獨立與排風系統，無論排風系統如何波動柜內氣流平衡都不會受到影響。Ⅱ級B2必須通過硬管連接，密封地連接到排風系統上，排風系統的排風量和靜壓必須與安全柜制定要求一致。在安裝有多臺Ⅱ級B型生物安全柜時，應各自使用獨立的排風管道，不能共用排風管道。
誤區四：有生物安全柜，就一切“OK”了
安全柜的使用和局限應向每個操作者說明，嚴格按要求操作，如使用提前開機“自凈”、柜內物品的擺放合理、定期保養驗證等。當操作失誤或發生泄漏、破損時，生物安全柜不能夠保護操作者。生物安全柜前的空氣幕很脆弱，極易受到干擾而造成污染。實驗中不能隨意開啟前窗的位置，操作動作緩和，手臂避免頻繁出入安全柜，以防止打擾氣流。在安全柜工作時，開關房門、人員在房間內走動、甚至在操作人員背后咳嗽等都會形成湍流而增加微生物氣溶膠溢出量，而造成實驗室污染。國外學者Oster曾報道，工作人員在安全柜內用吸管吸取立克次體懸液，另外一人在柜旁與之談話14 分鐘后即感染發病。有很多污染事件是因為實驗人員違反操作規程、注意力不集中、操作動作不穩定、操作方法或器材不當所致。
因此，操作人員必須牢固樹立安全意識，養成良好操作習慣，杜絕違規操作，嚴格遵照微生物學標準操作規程和生物安全實驗室操作規程，并使用規范的實驗器材。個人防護是防止實驗室氣溶膠感染的最后一道防護，通常由物理防護和疫苗免疫兩種，物理防護主要是對呼吸道和眼睛的防護，如防風鏡、口罩、防護面罩、正壓頭盔和正壓工作服等。生物安全柜投入使用后，其管理是一項重要的工作，也是一項薄弱的環節，由于設備人員、實驗人員責任界限不清，疏于管理，給實驗室安全帶來極大隱患，必須建立科學的管理制度，嚴格執行，責任落實到人，并進行監督，確保實驗室安全。